Seguito di Grisaia no Meikyuu La storia è ambientata nella Mihana Academy, nominalmente una scuola esclusiva ma di fatto un collegio di clausura ove alcuni studenti particolari vengono educati lontano dalle influenze del mondo esterno. La scuola ospita cinque studentesse occupate nella loro ripetitiva routine quotidiana. Un giorno tuttavia, alla Mihana arriva Yuuji Kazami, un nuovo ragazzo in veste di studente…