Quando Gintoki viene a conoscenza della presenza di un pirata di film ad una premiere, si mette alla ricerca della telecamera nascosta e viene trasportato in una versione di Edo fredda e post-apocalittica, dove una misteriosa piaga chiamata "White Plague" ha decimato la popolazione mondiale. Successivamente si scopre che il pirata di film non era effettivamente un truffatore, ma una macchina del tempo sottoforma di androide, e che Gintoki è stato portato cinque anni nel futuro! Shinpachi e Kagura, i compagni di Yorozuya, hanno litigato e ora stanno combattendo come vigilanti solitari e lui stesso è sparito da diversi anni dopo aver scarabocchiato uno strano messaggio sul giornale. Dovendo risolvere la situazione in cui è stato messo dall'androide, Gintoki riunisce il team Yorozuya per investigare sulla White Plague e presto scopre che la chiave per salvare il futuro giace nell'oscurità del suo passato. Determinato nell'affrontare un pericoloso nemico, fa un'importante scoperta: con un gruppo di amici e alleati al suo fianco, non deve combattere da solo.