La storia ruota intorno a quattro persone della Terra, gli studenti Makoto Mizuhara, Katsuhiko Jinnai e Nanami Jinnai, e l’insegnante di storia Masamichi Fujisawa, misteriosamente trasportati nel fantastico mondo di El Hazard, in cui è in atto una terribile guerra che vede schierate le nazioni umane da un lato, e le tribù di esseri simili ad insetti chiamati Bugrom. Ad aggiungere ulteriore complessità alla vicenda, l’arrivo dei quattro terrestri su El hazard, ha fornito ad ognuno di loro una particolare abilità. Per esempio, Katsuhiko ha acquisito il potere di comunicare con i Bugrom, e successivamente userà il proprio potere per diventare il leader dei Bugrom, mentre sua sorella può distinguere le illusioni. L’alcolizzato professor Fujisawa, d’altro canto, ha acquisito una forza ed una agilità sovraumana, ma soltanto quando è sobrio. Il potere di Makoto invece si rivelerà molto più tardi nella storia